Проблема в The Bat! (<CR> handling)
Некорректная обработка символов 0x0D CR не закрытых символами 0x0A LF ввода POP3-сервера приводит к тому, что часть письма воспринимается как ответ сервера, что приводит к невозможности получения последующих писем с сервера...